Koentsyymi, välillä käytetään nimitystä orgaaninen kofaktori, on
yhdiste, joka muodostaa entsyymin sitoutumalla entsyymin
proteiiniosaan. Silloin muodostuu toimiva ja aktiivinen entsyymi.
Koentsyymi on usein vitamiini, vitamiinin typpinen yhdiste tai
hivenaine. Koentsyymit osallistuvat entsyymien reaktioihin
kulumatta itse reaktioissa.
Kofaktorin ero koentsyymiin on yhteydestä riippuen
orgaanisuudessa. Kun sitoutuva yhdiste on hivenaine, kuten
sinkki, kupari tai rauta, niin puhutaan kofaktorista. Jos se on
orgaaninen, kuten vitamiini, niin puhutaan koentsyymistä - mutta
usein käytetään kaikista yleisnimitystä koentsyymi.